公司系统电厂脱硫工程于2008年底全部投运,电厂脱硝工程2013年全部完成改造,外二、外三、吴二火电机组2016年均完成超低排放改造。2016年公司系统发电企业综合脱硫效率超过97%,综合脱硝效率超过86%。